ALTERAÇÕES CONFORMACIONAIS E INIBIÇÃO ALOSTÉRICA DAS PROTEÍNAS 70 DE CHOQUE TÉRMICO INDUZÍVEL POR ESTRESSE (Hsp70) E CONSTITUTIVA (Hsc70) PELO INIBIDOR VER-155008
Hsp70; Inibidores da Síntese de Proteínas; Simulação de Acoplamento Molecular.
A proteína 70 de choque térmico humano induzível por estresse (Hsp70, também conhecida como Hsp72 ou HspA1A) tem emergido como um alvo molecular interessante para a terapia do câncer devido aos seus papéis críticos na proteção celular e no enovelamento de proteínas. No contexto do câncer, a Hsp70 desempenha papel essencial na promoção da sobrevivência e proliferação de células cancerígenas. Várias estratégias foram desenvolvidas para atingir a Hsp70 na terapia do câncer, inibindo ou modulando a atividade da Hsp70 ou a rede de interações proteína-proteína da Hsp70. Estudos anteriores relataram o modo de ação do VER-155008, uma pequena molécula que atua como um inibidor de Hsp70 em linhagens celulares de câncer. Portanto, o objetivo deste trabalho é investigar a seletividade e ligação de afinidade entre o inibidor VER-155008 e as proteínas Hsp70 e Hsc70. Para o alcance do objetivo da pesquisa, será realizado docagem molecular consensual e alinhamento estrutural do inibidor no sítio de ligação à proteína, onde esse protocolo fornece uma estimativa mais precisas das poses de ligação do ligante. Além disso, será realizado simulações de dinâmica molecular de estruturas da Hsp70 e Hsc70, com finalidade de analisar as mudanças conformacionais alostéricas e as interações intermoleculares quando complexadas com o inibidor. Por fim, para a análise de energia livre nessas ligações, será realizado cálculos específicos de energia de ligação livre, sendo calculados computacionalmente usando método de mecânica molecular de solvatação contínua de área superficial de Poisson Boltzmann no pacote Amber.