MICROBIOMA E CARACTERIZAÇÃO DE BACTERIÓFAGOS ANTI- Enterococcus faecium MULTIRRESSISTENTES DO ESGOTO BRUTO DE SANTARÉM, PARÁ
Enterococcus, resistência antimicrobiana, Saúde Única, águas residuais, atividade lítica.
O esgoto urbano abriga genes de resistência antimicrobiana, e a determinação do seu microbioma é uma ferramenta poderosa para monitorar riscos à saúde, compreender o ecossistema microbiano urbano e impulsionar soluções sustentáveis e inovadoras. Enterococcus faecium é uma espécie de bactéria Gram-positiva comum em esgoto, comensal do trato gastrointestinal de humanos e animais, patógeno oportunista que causa infecções urinárias, endocardite, bacteremia e outras infecções. Adaptável e resistente, está classificada na lista de patógenos de alta prioridade para pesquisa e desenvolvimento de novos antibióticos pela Organização Mundial de Saúde 2024. Com o aumento da resistência antimicrobiana e a ineficácia de muitos antibióticos frente a superbactérias como E. faecium, os bacteriófagos têm se tornado uma alternativa promissora. Este estudo tem como objetivo analisar a composição do microbioma bacteriano presente no esgoto bruto da cidade de Santarém, Pará, utilizando abordagens moleculares e bioinformática, com isolamento e caracterização de bacteriófagos para o controle de cepas multirresistentes de E. faecium. Foi analisado o perfil microbiológico do esgoto bruto de Santarém-PA, em dois períodos, nos meses de setembro de 2024 (estiagem) e março de 2025 (cheia), utilizando o gene 16S rRNA, a partir do sequenciamento de nova geração na plataforma Illumina NextSeq e análise no software Qiime. Para o isolamento de E. faecium as amostras foram submetidas a enriquecimento prévio em água peptonada suplementada com 7% de NaCl e posteriormente plaqueadas em meios de cultura seletivos: Ágar Base M-Enterococcus, Ágar Manitol Salgado e Ágar Baird Parker com adição de gema de ovo 50% enriquecida com 0,1% de telurito de potássio. Seguiu-se as análises morfológicas, bioquímicas, moleculares e antibiograma conforme o protocolo Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI, 2025) dos isolados obtidos. Para triagem de bacterófagos, cepas E. faecium serão utilizadas como hospedeiras, seguido de avaliação de perfil lítico por meio de teste Host range. O microbioma das amostras revelou predominância do Filo Myxococcota (32%) e do gênero Pseudomonas (12%) no esgoto 1, enquanto o esgoto 2 apresentou maior abundância de Pseudomonas (37%) e Aeromonas (23%). Pelo isolamento tradicional 27 isolados característicos do gênero Enterococcus foram obtidos, destes, até o momento, 7 cepas foram confirmadas como E. faecium por meio de sequenciamento, entre estes dois isolados (30EC1 e 27EC1) com perfil de multirresistência. Diante da crescente complexidade no desenvolvimento de novos antibióticos, estratégias como o uso de bacteriófagos integradas ao conceito de Saúde Única, mostraram-se promissoras no enfrentamento da resistência bacteriana.